Место, где находилась пещера, принадлежало тюменскому татарину по имени Илигей. Узнав о прибытии инока и опасаясь возникновения монастыря на своей земле, Илигей решил напасть на него и уничтожить его. Однако во сне Илигею явилась Богоматерь и запретила ему причинять вред отшельнику. Устрашенный этим чудесным явлением, Илигей подошел к Далмату и пожертвовал всю Приисетскую вотчину во владение для будущего монастыря, став его первым благотворителем. По преданию, Илигей подарил Далмату свою шишак и кольчугу, которые хранились в монастыре как святыни до закрытия обители в начале XX века.
В XVII веке Далматовский монастырь неоднократно подвергался разрушению в результате напений калмыков и башкиров в 1651 и 1662 годах, однако он был восстановлен. Еще при жизни старца Далмата его сын, архимандрит Исаак, стал настоятелем монастыря и в период с 1705 по 1719 годы возглавил строительство каменного Успенского собора с Димитриевской церковью и колокольней. В 1713-1763 годах была построена каменная монастырская стена с башнями, заметно укрепившая монастырь. Благодаря этому, он смог выдержать осаду восставших крестьян в 1762-1763 годах (известную как "Дубинщина") и штурм отрядов Е. Пугачева в 1774 году. Монастырь обладал значительными земельными владениями, на которых проживали монастырские крестьяне, а также различными хозяйственными предприятиями, включая железноделательный завод (позднее на его месте был основан город Каменск-Уральский). К середине XVIII века Далматовский монастырь занимал первое место среди обителей восточной части Российской Империи по ряду экономических показателей.
Далматовский монастырь также являлся центром духовного просвещения и образования в Сибири. В 1714 году было открыто первое училище для детей церковнослужителей в Зауралье. В 1735 году была учреждена славяно-греко-российская школа, а в 1761 году – семинария. В 1816 году было открыто уездное духовное училище, а в 1846 году – училище для детей служителей и крестьян. В 1884 году была основана церковно-приходская школа с тремя отделениями, а в 1899 году – «второклассная» церковно-приходская школа с образцовой одноклассной формой обучения и общежитием для учеников в монастырских зданиях. В монастыре также находилась богатая библиотека, известная как "книгохранилище", первое упоминание о которой относится к 1679 году.
В первой половине XIX века над северными святыми вратами Далматовского монастыря была построена каменная надвратная церковьо имя святого апостолаоанна Богослова заменяая сгоревш деревяную церковь, которая была срублена в 1673-1674 годах над восточными святыми вратами. В период с 1871 по 1881 годы была построена церковь во имя иконы Божией Матери "Всех скорбящих Радость" вместе с приделами, посвященными святителю Стефану, епископу Великопермскому, и преподобным Исаакию, Далмату и Фавсту. В 1896 году к этой церкви была пристроена каменная часовня-усыпальница над могилой преподобного Далмата, где хранились его портрет, монашеское облачение, шишак и кольчуга. В 1904 году в монастыре был принят общежительный устав, а в 1912 году монастырь получил статус второго класса.
Почитание старца Далмата, основателя Успенской обители, было широко распространено среди жителей окрестных губерний Урала и Сибири. В 1864 году Пермская духовная консистория установила ежегодный крестный ход в селе Далматово 24 июня, в день его преставления, согласно указу. В 1871 году была предпринята попытка обнаружить мощи этого подвижника. В это время были зафиксированы свидетельства о его чудесах, исцелениях и явлениях.
Среди известных лиц, связанных с Далматовской обителью, можно упомянуть сподвижника Далмата и будущего первого ахиепископа Архангельского и Холмогорского Афанасия (Любимова), который был постриженником обители. Также в Далматовском училище получал образование будущий начальник Русской духовной миссии в Иерусалиме и известный церковный ученый архимандрит Антонин (Капустин), изобретатель радио А.С. Попов, домашний учитель М.Ю. Лермонтова А.Ф. Мерзляков, организатор Томского университета и попечитель Западно-Сибирского учебного округа В.М. Флоринский, а также полярный исследователь К.Д. Носилов. В монастыре также похоронены сын Далмата, архимандрит Исаак, дядя архимандрита Антонина (Капустина), епископ Екатеринбургский Иона (Капустин), зауральский краевед, просветитель и писатель А.Н. Зырянов.
В результате революции в начале 20-х годов монастырь был превращен в музей, а затем, в конце 20-х годов, службы в нем были прекращены. Нет информации о репрессиях в отношении братии. В 1930 году единственный на Урале Далматовский музей-монастырь был закрыт, а купола были снесены со Скорбященской церкви. Чудотворная Далматская икона Божией Матери, главная святыня, исчезла (ее местонахождение в настоящее время неизвестно). Благодаря усилиям местного краеведа и ученого В.П. Бирюкова удалось спасти и вывезти в Шадринск большую часть монастырского архива. В период советской власти на территории монастыря размещались различные учреждения, включая театр. Основные разрушения произошли в послевоенные годы, особенно с 1945 года, когда монастырский комплекс был передан заводу "Молмашстрой" (завод "Старт"). Успенский собор, главный храм обители, был обезглавлен и переоборудован под цех, а колокольня была снесена. Часть монастырской стены была разрушена, а северо-западная башня, известная как "Красный бастион", была разобрана. На территории монастыря были построены корпуса заводских цехов и городская котельная. В 1952 и 1974 годах Далматовский монастырь был признан памятником истории и культуры республиканского (общероссийского) значения постановлениями Совета Министров РСФСР.
В сентябре 9 года в городе Далматово была зарегистрирована православная община, которой был передан Скорбященский храм. Затем, 6 мая 1992 года, по решению Священного Синода Русской Православной Церкви, монастырь был возрожден, и монашеская жизнь была возобновлена. Завод "Старт" покинул территорию монастыря. 23 февраля 1993 года, в связи с образованием самостоятельной Курганской епархии из Свердловской, монастырь сменил епархиальное подчинение. В 1994 году были обретены мощи преподобного Далмата Исетского, который является местночтимым святым и в 2004 году был включен в лик Собора Сибирских святых по благословению Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II. В том же 1994 году в монастыре произошел сильный пожар, в результате которого юго-западные корпуса были полностью уничтожены. На данный момент в братии монастыря насчитывается 17 человек, включая 15 монашествующих, а наместником является игумен Варнава (Аверьянов). В монастыре находятся несколько действующих храмов, включая храм, посвященный иконе Божией Матери "Всех скорбящих Радость", с крестильной церковью, а также надвратная церковь, посвященная святому апостолу и евангелисту Иоанну Богослову. Рядом с монастырем находится деревянная часовня с купальней у источника преподобного Далмата. В монастыре также имеются тепличное хозяйство, скотный двор, пекарня и мастерские. Действует воскресная школа и православная библиотека. Для паломников гостиница, а мужчины-паломники размещаются в братском корпусе.
Как добраться
Из города Челябинск в Далматово отправляется автобус по маршруту 538/1 в понедельник, пятницу и воскресенье в 15:30. Время в пути составляет 4 часа и 38 минут.
Между городами Курганом и Екатеринбургом существует ежедневное автобусное сообщение. Время в пути от Екатеринбурга до поворота на Далматово составляет 4 часа и 12 минут, а от Кургана — 3 часа и 20 минут.